Missing coverage evidence...
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TTGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCT  >  minE/1627023‑1627087                                                                 | ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCTCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:739107/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACGATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:569643/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1908214/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:982288/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:980814/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:907171/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:883356/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:854127/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:827986/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:215176/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:2103830/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:2067585/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:2043353/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:200780/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1016847/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1847246/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1744950/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1721215/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1715698/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1669135/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1583679/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1538802/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:147947/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1363645/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1348704/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1226186/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1083820/65‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1040830/65‑1 (MQ=255) gtGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:1369120/64‑1 (MQ=255)                  ggATCTGGCTCCCAGCAAGCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCt  <  1:330822/48‑1 (MQ=255)                                                                 | TTGCTCGGCGGTTCGGCGGATCTGGCTCCCAGCAACCTGACCATCTGGAAAGGTTCTGTTTCGCT  >  minE/1627023‑1627087

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑