Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1635378	1635399	22	42 [0]	[0] 10	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

GGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGCAT  >  minE/1635311‑1635377                                                                   | ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:2187244/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1633924/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1733158/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1739726/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1802322/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1022121/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1889956/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1947206/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:2159097/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1842993/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:2305642/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:545887/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:57503/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:584663/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:704792/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:713599/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:950666/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:102265/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1404062/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1292000/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1065747/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1109470/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1578094/1‑67 (MQ=255) ggTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1116937/1‑67 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1199330/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:942929/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:935858/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:90509/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:860154/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:823747/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1107916/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1193007/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:239682/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:2305226/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1245384/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:2185221/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:129876/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1313644/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1845314/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1316544/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1419985/1‑62 (MQ=255)      cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGcat  >  1:1484991/1‑62 (MQ=255)                                                                   | GGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGCAT  >  minE/1635311‑1635377

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑