Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1657375	1657480	106	41 [0]	[0] 6	ppk	polyphosphate kinase, component of RNA degradosome

CAAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTC  >  minE/1657308‑1657374                                                                   | caAGGGCTTCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:612319/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2249164/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1135502/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1978985/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2039423/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2045392/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:207893/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2098468/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2124882/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2141387/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2156522/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1968911/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:301141/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:352329/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:668711/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:76275/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:906144/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:918740/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:982279/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1443380/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1173107/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1174739/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1255442/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1271594/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1316572/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1400577/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:14230/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1952946/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1525253/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:155791/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1568285/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1625210/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1676629/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1694731/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1730459/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:177548/67‑1 (MQ=255) caAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1942514/67‑1 (MQ=255)  aaGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:33957/66‑1 (MQ=255)            cAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:1332878/56‑1 (MQ=255)               tGGTATCACCCTGAAGCTAAATATCCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:2070882/53‑1 (MQ=255)                            aaGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTc  <  1:556272/40‑1 (MQ=255)                                                                   | CAAGGGCTGCCCAGTGGTATCACCCTGAAGCTAAATAACCTTGTCGATAAAGGCCTGGTTGATCGTC  >  minE/1657308‑1657374

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑