Missing coverage evidence...
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CGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAC  >  minE/1689362‑1689424                                                               | cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCTATAc  <  1:294260/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:2129143/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:938221/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:835576/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:699717/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:629834/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:62447/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:579476/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:474016/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:413546/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:399050/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:2243586/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:2240028/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:2208164/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1199292/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1819242/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1783522/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1742140/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:172284/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1710363/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1406377/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1367155/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1333454/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1285488/63‑1 (MQ=255) cGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1283905/63‑1 (MQ=255)               tACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1644201/49‑1 (MQ=255)                          gCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAc  <  1:1211826/38‑1 (MQ=255)                                                               | CGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATAC  >  minE/1689362‑1689424

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑