Missing coverage evidence...
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CTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAGC  >  minE/1734454‑1734520                                                                   | cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:2246895/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:996416/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:981318/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:691176/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:688508/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:659899/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:57712/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:563658/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:505826/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:458073/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:372966/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:321595/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:26131/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:252124/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:234422/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:2313807/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1006324/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:2175/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1927998/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1860383/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1777104/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1757572/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1714689/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1684984/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1656452/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1518161/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1470257/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1340347/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1208825/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1205322/1‑67 (MQ=255) cTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAgc  >  1:1110926/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CTTAGGCATAAACTGCCGGAACAGTTCCCTGCTCTTTAAAGGTTTACCGCCAAGATACGGCTTAAGC  >  minE/1734454‑1734520

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑