Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1777317	1777363	47	39 [0]	[0] 7	trmD	tRNA (guanine‑1‑)‑methyltransferase

GGGCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCA  >  minE/1777254‑1777316                                                               | tggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1617592/62‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:458506/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:2020966/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:2100623/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:2176753/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:2177791/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:2248180/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:2288038/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:258341/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:278155/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:456501/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:2018391/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:700507/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:75497/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:776443/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:799818/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:887262/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:90779/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:917245/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:921250/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1659319/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1113540/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1170193/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1242685/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1329404/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1388940/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1411108/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1482823/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1498930/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1085434/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1671696/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1679946/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1716289/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1912594/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1967669/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1977825/63‑1 (MQ=255) gggCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1989919/63‑1 (MQ=255)     ttACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:1896427/59‑1 (MQ=255)     ttACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCa  <  1:855921/59‑1 (MQ=255)                                                               | GGGCTTACGCCATCCCATCATGTTTATGTTGCTGTTGTGCGTGTTCCGTTTTGAACTCCGCCA  >  minE/1777254‑1777316

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑