Missing coverage evidence...
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CACCGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGAGAG  >  minE/1967012‑1967078                                                                   | caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGCCGGGagag  >  1:1097747/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:2264800/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:812333/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:79416/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:777385/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:692852/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:689532/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:532852/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:400693/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:37479/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:360082/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:320199/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:2315705/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:2262982/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:2184763/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:2071737/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1995576/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1860143/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1751414/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1648038/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1569432/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1513763/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1365391/1‑67 (MQ=255) caccGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGagag  >  1:1215907/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CACCGCGCGCGATGTTTGCCAGTTGCTCTTCAGTTCGTTCCTGCTGCGCCAGGTTCTGACGGGAGAG  >  minE/1967012‑1967078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑