Missing coverage evidence...
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CAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGGCGC  >  minE/2102391‑2102457                                                                   | cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1996409/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:955490/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:854268/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:747506/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:635203/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:555344/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:544652/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:373031/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:284484/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:2192623/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:2138139/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:2100279/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:2033996/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:2025395/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1149899/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1979021/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1973551/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1947443/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1671245/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1652566/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:164024/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1554187/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:155313/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1427151/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1405406/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1363923/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1272934/67‑1 (MQ=255) cAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1259599/67‑1 (MQ=255)  aaCATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:254373/66‑1 (MQ=255)                              aataatGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:799910/38‑1 (MQ=255)                              aataatGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGgcgc  <  1:1173762/38‑1 (MQ=255)                                                                   | CAACATTGATGATGAGATTGGCGACGACGAATAATGGATTTTCCACAAAGGGTTAATGGTTGGGCGC  >  minE/2102391‑2102457

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑