Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2170949	2170953	5	40 [0]	[0] 30	rpoN	RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor

GTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATCGAC  >  minE/2170882‑2170948                                                                   | gTGGAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:945627/67‑1 (MQ=255) gTGAATAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:242832/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:306586/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1066608/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:2171831/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:2188681/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:2252495/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:248486/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:265686/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:278506/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:301842/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:2116280/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:384644/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:464039/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:514142/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:531738/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:570271/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:821137/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:960204/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1703272/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1091584/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1170323/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1368199/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1389931/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:151564/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1526418/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1592450/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:19364/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1731171/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1731185/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:173147/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1760275/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1858129/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1882729/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1897155/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1927285/67‑1 (MQ=255) gTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTCTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1541441/67‑1 (MQ=255)  tGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:529000/66‑1 (MQ=255)    aagaaTATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:471021/64‑1 (MQ=255)             tGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATcgac  <  1:1795017/55‑1 (MQ=255)                                                                   | GTGAAGAATATATGAAACCGATGGTACTGGCCGATATCGCCCAGGCTGTCGAAATGCATGAATCGAC  >  minE/2170882‑2170948

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑