Missing coverage evidence...
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ACGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAT  >  minE/2180138‑2180203                                                                  | aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:393759/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:98772/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:983276/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:941177/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:928960/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:777417/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:749909/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:676219/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:506863/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:448115/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1063784/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1893128/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1849768/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1769108/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1396372/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1191747/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1182170/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1149586/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1128624/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:1083500/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGGCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:663165/66‑1 (MQ=255) aCGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTAATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:2189857/66‑1 (MQ=255)                               tGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAt  <  1:665940/36‑1 (MQ=255)                                                                  | ACGCGAAACCTTGTCGATTGTGGGCTGGCGTGATGTCCCCACTAACGAAGGCGTGCTGGGTGAAAT  >  minE/2180138‑2180203

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑