Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2239391	2239401	11	18 [0]	[0] 8	zraS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ZraR

GCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGT  >  minE/2239350‑2239390                                         | gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:1341462/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:91142/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:880059/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:829120/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:814465/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:656331/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:574499/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:325188/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:2195807/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:2130566/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:2117543/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:194290/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:1485808/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:1483039/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:1340596/41‑1 (MQ=255) gCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATACAACAGGACCTGAGt  <  1:933384/41‑1 (MQ=255)  ccTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:2191822/40‑1 (MQ=255)  ccTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGt  <  1:1590018/40‑1 (MQ=255)                                         | GCCTGAATAGCATTGAGATAGAGATTCAACAGGACCTGAGT  >  minE/2239350‑2239390

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑