Missing coverage evidence...
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CTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGAA  >  minE/2432973‑2433038                                                                  | ctactaCACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1981284/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:421960/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2035068/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2047799/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2215517/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2258525/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2310413/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2311436/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:419097/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:203459/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:556604/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:624824/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:706836/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:707148/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:816985/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:914751/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:97138/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:983658/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2021226/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1232754/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1239061/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1345146/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1513854/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1537445/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1728263/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:183722/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1856910/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1858958/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1966914/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1985261/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:109959/66‑1 (MQ=255) cTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTCCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1413146/66‑1 (MQ=255)         cTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:2108349/58‑1 (MQ=255)                  aaaCACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1416089/49‑1 (MQ=255)                  aaaCACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGaa  <  1:1209739/49‑1 (MQ=255)                                                                  | CTACCACACTATGAGCAAAACACATTTAACAGAACAGAAGTTTTCCGACTTCGCCCTGCATCCGAA  >  minE/2432973‑2433038

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑