Missing coverage evidence...
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CTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGAA  >  minE/2579348‑2579413                                                                  | cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGTCGaa  <  1:1244/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:643254/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:208898/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:2232829/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:22362/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:2259039/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:2278750/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:2310669/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:550222/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:598254/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:621481/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:2062796/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:645020/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:692183/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:707489/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:708723/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:711303/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:831187/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:897333/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1786120/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1095090/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1193427/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1238045/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:126104/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1332970/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1560124/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1574188/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1691707/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1737732/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1825182/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1882064/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1910224/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1988144/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:2028548/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:2043062/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTCGCGaa  <  1:1022765/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTAGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:335363/66‑1 (MQ=255) cTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACCCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:1947593/66‑1 (MQ=255)  tGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGCTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGaa  <  1:322639/65‑1 (MQ=255)                                                                  | CTGGAAAAAGATCCGCAGCTTAAAACGCAGTTCCTCGAAGTCTATCCGCAAGGTTTCAGTGGCGAA  >  minE/2579348‑2579413

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑