Missing coverage evidence...
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TGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTACC  >  minE/2609460‑2609526                                                                   | tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:2113155/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:916540/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:887303/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:848465/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:735714/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:677532/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:563919/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:558296/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:497327/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:263057/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1030317/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1853150/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1798625/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1714927/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1641709/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1605714/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1504276/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1502335/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1434367/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1375726/67‑1 (MQ=255) tGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:1104842/67‑1 (MQ=255)  gcgcGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:37305/66‑1 (MQ=255)                      gggCGATAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTAcc  <  1:851734/46‑1 (MQ=255)                                                                   | TGCGCGTCACTGTATGTTTGGGGGCGTTAAACAGCGTTTCTACATCGCCCTGTTCGACAATCTTACC  >  minE/2609460‑2609526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑