Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	228312	228347	36	8 [0]	[0] 16	phoE	outer membrane phosphoporin protein E

GTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATT  >  minE/228245‑228311                                                                   | gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCCCCAAAtt  >  1:1196169/1‑67 (MQ=255) gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:135319/1‑67 (MQ=255) gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:1574859/1‑67 (MQ=255) gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:1947745/1‑67 (MQ=255) gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:2294584/1‑67 (MQ=255) gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:487728/1‑67 (MQ=255) gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:511030/1‑67 (MQ=255) gTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAAtt  >  1:722981/1‑67 (MQ=255)                                                                   | GTCGCCAGACCGCTGGCGCGTTTGGTCATAAAGTTGTCGGTCTGCGCCGAGGAATCGCCACCAAATT  >  minE/228245‑228311

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑