Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	247980	247997	18	25 [0]	[0] 2	phoR/brnQ	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB/predicted branched chain amino acid transporter

TAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTT  >  minE/247913‑247979                                                                   | tAACGCGGTAAATCGAATAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1804200/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1116709/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:977690/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:971640/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:946086/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:930049/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:752577/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:735935/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:611732/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:464602/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:461934/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:445407/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:321636/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:269499/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:2213421/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:2181575/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:2115950/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1832313/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1764808/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1620179/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1533925/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:126650/67‑1 (MQ=255) tAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1039655/67‑1 (MQ=255)  aaCGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:2249118/66‑1 (MQ=255)                                cgcgCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGtt  <  1:1704224/36‑1 (MQ=255)                                                                   | TAACGCGGTAAATCGAAAAACTATTCTTCGCCGCGCCTGGTTGGGAGTATTTCCCGCTAAAATTGTT  >  minE/247913‑247979

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑