Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	248666	248667	2	19 [0]	[0] 10	brnQ	predicted branched chain amino acid transporter

TTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCA  >  minE/248599‑248665                                                                   | ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1874629/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:964325/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:876734/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:772845/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:702820/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:373985/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:2301454/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:196841/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1952827/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1890362/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:180410/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1409562/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1257648/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1189528/67‑1 (MQ=255) ttATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1030961/67‑1 (MQ=255)         aCGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:174632/59‑1 (MQ=255)         aCGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1684489/59‑1 (MQ=255)                    tCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1001048/48‑1 (MQ=255)                              tCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCa  <  1:1622093/38‑1 (MQ=255)                                                                   | TTATCAAAACGCTGCGTTTTCTAACGGCTTCGTTAACGGCTATCTGACCATGGATACGCTGGGCGCA  >  minE/248599‑248665

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑