Missing coverage evidence...
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AATGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGC  >  minE/274974‑275015 |                                          aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:457137/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:983375/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:947678/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:760348/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:62883/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:602818/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:588755/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:582767/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:542241/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:46612/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:1271904/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:361459/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:347553/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:254121/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:2166393/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:2019459/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:1813774/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:1713273/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:1658462/1‑42 (MQ=255) aaTGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGc  >  1:1422732/1‑42 (MQ=255) |                                          AATGGCAATACCGATTAATGCTTCGCTGGCACCTTGCAGAGC  >  minE/274974‑275015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑