Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	342802	342841	40	2 [0]	[0] 14	cueR	DNA‑binding transcriptional activator

CGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCT  >  minE/342842‑342906 |                                                                 cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:1006977/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:1053843/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:1176571/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:1399426/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:1457955/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:1521765/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:1529384/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:2315275/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:269995/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:533533/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:60739/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:664060/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:900892/65‑1 (MQ=255) cGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCt  <  1:977574/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CGGCTGCTGTCATCATCGGGCAGGGTGATTAAGACGAGACGGCTCGGATATGTAGGGTTATCCCT  >  minE/342842‑342906

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑