Missing coverage evidence...
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TTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGG  >  minE/456475‑456540 |                                                                  ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTTGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1820963/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:2027888/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:987329/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:951935/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:941998/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:879542/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:47323/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:42502/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:30304/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:27588/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:271771/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:2244825/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:2183441/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:2159523/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:2119310/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:2103661/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:204948/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1001341/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1928563/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1901022/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1894604/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1824979/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1822113/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1759168/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:163983/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1550265/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1521050/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1407735/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1346783/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1226668/66‑1 (MQ=255) ttGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCggg  <  1:1155770/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TTGCACTCCTCCGTGGAATACGTGGTCTGGTTTTTAGGTTTTCAACCGGGCTTCCCGTATCTCGGG  >  minE/456475‑456540

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑