Missing coverage evidence...
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ACACCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCA  >  minE/528167‑528232 |                                                                  acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGTAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1266013/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGa                          >  1:532252/1‑42 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:467188/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:222461/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:2240000/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:2253539/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:2259756/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:315108/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:332759/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:333108/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:379374/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:394603/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:450987/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:2141073/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:545210/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:619524/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:679716/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:703028/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:73530/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:736206/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:917962/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:991928/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1630892/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1093860/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:118252/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1226528/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1293341/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1307081/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:13125/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1399108/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1409696/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1428870/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1527659/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:2209589/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1662047/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1734967/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1754677/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:178357/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1827795/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1869961/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1870044/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:1047358/1‑66 (MQ=255) acacCGCTTCCAGCACACAGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCa  >  1:2029319/1‑66 (MQ=255) |                                                                  ACACCGCTTCCAGCACACCGATCCCCGCCGGAATATGCACGATGACGCCAGCAATACTACTAACCA  >  minE/528167‑528232

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑