Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	541163	541203	41	10 [1]	[0] 41	rhtA/ompX	threonine and homoserine efflux system/outer membrane protein

GCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAT  >  minE/541204‑541268 |                                                                 gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTActt  <  1:2178348/65‑3 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:67193/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:339596/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:366159/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:437616/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:460885/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:519154/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:560313/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:6557/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:656983/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:65908/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:2209889/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:676706/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:744614/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:760121/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:869174/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:879281/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:9499/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:952584/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:975043/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:982993/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1613119/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1158988/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1265101/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1303594/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1352036/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1403026/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1413072/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1505932/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1569185/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1585006/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:314010/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1760265/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1954582/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1960807/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:202075/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:2064753/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:2079709/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:2161155/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:2170479/65‑1 (MQ=255) gCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAt  <  1:1047379/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACAT  >  minE/541204‑541268

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑