Missing coverage evidence...
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GGCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTC  >  minE/559011‑559077 |                                                                   ggCTGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:777576/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCTATATTGCTGGCGCAAAACATTGCACAATTc  <  1:2105024/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1978525/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:86251/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:847287/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:814964/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:763416/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:739371/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:621405/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:483154/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:385785/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:2285244/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:2254243/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:22512/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:2137394/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:2103962/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1014850/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1911687/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:190506/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1856378/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1808314/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1747381/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1710375/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1709758/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1566594/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1545279/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1522766/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1334461/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1300592/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1150145/67‑1 (MQ=255) ggCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTc  <  1:1069186/67‑1 (MQ=255) |                                                                   GGCGGGAGTGGTGTGGTTTATCGTCACCTGTCTGGCAATATTGCTGGCGCAAAACATTGAACAATTC  >  minE/559011‑559077

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑