Missing coverage evidence...
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TTACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGCC  >  minE/568005‑568070 |                                                                  ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGTACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1288599/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:607733/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1988919/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:2105712/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:2193728/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:2253745/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:233678/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:253868/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:505718/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:543521/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:574905/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:583489/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1929867/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:61557/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:654753/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:656813/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:738694/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:790713/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:907732/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:971968/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:977877/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:145909/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1073009/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1148687/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1153316/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1159530/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1355481/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1357173/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1377697/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1378253/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1442286/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1953987/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1476077/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1539848/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1589786/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1636406/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1750626/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:175178/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1806027/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1883107/66‑1 (MQ=255) ttACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGcc  <  1:1047463/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TTACAGCAGCCGCAAACACCCGCACGGCAGGCAGCGACAACCGGAACGTTATTGCTTTCCAGCGCC  >  minE/568005‑568070

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑