Missing coverage evidence...
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CGGTATTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGG  >  minE/625289‑625359     |                                                                   cgGTATTCGCGTGGGGGGCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTg      <  1:283236/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTTGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:21556/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:495979/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:2158942/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:322045/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:38958/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:415123/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:428508/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:488007/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1947268/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:53263/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:537626/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:631881/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:761669/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:93405/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:962945/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:966931/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1492300/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1079442/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1216407/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1237638/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1266816/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1296013/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1325533/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1383528/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1395947/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1057982/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1539711/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1629880/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1691943/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1730589/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1793487/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1907285/67‑1 (MQ=255)     aTTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCgg  <  1:1908338/67‑1 (MQ=255)     |                                                                   CGGTATTCGCGTGGGGGTCGTATCGCGGGGATATGGTGGTAAGGCTGAATCTTATCCGCTGTTATTGTCGG  >  minE/625289‑625359

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑