Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	695575	695661	87	40 [0]	[0] 37	appC	cytochrome bd‑II oxidase, subunit I

TGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTTTG  >  minE/695662‑695728 |                                                                   tGTCCAGACTCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:894727/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGtttt  <  1:1385990/67‑2 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:2209388/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:2160235/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:2218493/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:252321/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:252984/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:384851/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:39713/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:468282/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:500879/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:590401/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:608499/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:610446/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:626873/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:677129/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:748068/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:812263/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:835588/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1570561/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1077878/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1085021/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1332814/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1359328/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:139347/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1407101/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1503085/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1506216/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1064747/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1602299/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1738696/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1741961/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:187300/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1957718/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:199509/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGAGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:413921/67‑1 (MQ=255) tGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTAGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTttg  <  1:1889239/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TGTCCAGACGCTGCGTGGCAAAATCGACCAGCATCGCTGGGTGCTGAAAATGGCGCTCTGGAGTTTG  >  minE/695662‑695728

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑