Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	971692	971699	8	10 [0]	[0] 34	lsrC	AI2 transporter

GGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGC  >  minE/971700‑971735 |                                    ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAGGACGGc  >  1:618145/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACgg   >  1:1985816/1‑35 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:322345/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:264321/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:329303/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:351683/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:490011/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:504260/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:533893/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:612906/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:661311/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:733032/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:805684/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:847492/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:852814/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:93040/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:931489/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:972199/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1019896/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:245750/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:2240889/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:2148728/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:2142408/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1906669/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1847422/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1674676/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1598215/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1567154/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1552743/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1369323/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1314420/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1222624/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1170546/1‑36 (MQ=255) ggtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGc  >  1:1051818/1‑36 (MQ=255) |                                    GGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGC  >  minE/971700‑971735

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑