Missing coverage evidence...
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CACTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTA  >  minE/1002810‑1002876 |                                                                   cacTTCCATCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1746626/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAATCGTa  <  1:2535/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1857151/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1854417/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:2077190/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:2078137/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:210078/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:2183304/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:2186994/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:220581/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:354971/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:376927/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:423890/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:80898/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:82259/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:831542/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:841287/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:923728/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1182990/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1815026/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1774028/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1665981/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1664161/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1641572/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:16301/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1625060/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1601394/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1578658/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1551536/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1472193/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1365015/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1363259/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1360677/67‑1 (MQ=255) cacTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTa  <  1:1300821/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CACTTCCAGCACAGGCATACCAGCAATCGGACTCTTCGGATCATCCTGCGCCGCCGGGTTAACCGTA  >  minE/1002810‑1002876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑