Missing coverage evidence...
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AGCTCTCGACCGTAGCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGC  >  minE/1094222‑1094299               |                                                                aGCTCTCGACCGTAGCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGgtgt                          <  1:1868434/54‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:2038662/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:917412/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:748580/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:740396/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:722961/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:549039/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:52300/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:503252/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:495798/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:484932/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:371315/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:267489/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:238369/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:2282022/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:205285/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1125873/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1930356/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1925350/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1772261/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1694398/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1575273/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:154298/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1386589/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1354455/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1245448/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1226368/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1192522/64‑1 (MQ=255)               gCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGc  <  1:1188641/64‑1 (MQ=255)               |                                                                AGCTCTCGACCGTAGCGACGAGGTGGTCGCGCAGCGGGCGTAAATAACGGGTGTGATAGAGCTGCAGAAAACGAGAGC  >  minE/1094222‑1094299

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑