Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1153197	1153216	20	2 [1]	[0] 22	spy	envelope stress induced periplasmic protein

CGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGG  >  minE/1153217‑1153281 |                                                                 cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1236888/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:948874/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:919440/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:81162/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:715524/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:68077/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:654424/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:636097/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:466581/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:419815/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:411908/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:2267070/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:2228020/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1848256/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1814801/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1572433/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1509336/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1346471/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1248791/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1033939/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGGCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:252107/65‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGGCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAgg  <  1:1948519/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CGTCAGCCGGTGCTGCGGTAGTGGTGTCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGG  >  minE/1153217‑1153281

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑