Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1166506	1166526	21	17 [0]	[0] 76	ynjD	predicted transporter subunit

CACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGC  >  minE/1166527‑1166592 |                                                                  cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCCCTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1830583/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCActc                              >  1:1114151/1‑38 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGgat                 >  1:936035/1‑51 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTgg           >  1:1652672/1‑57 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGt          >  1:1360439/1‑58 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACt     >  1:2021825/1‑63 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:1556940/1‑65 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:249262/1‑65 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:1923691/1‑65 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:2311823/1‑65 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:779221/1‑65 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:9010/1‑65 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:1156226/1‑65 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTg    >  1:1339567/1‑64 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:453160/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:461223/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:562557/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:477406/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:632548/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:352940/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:2267998/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:2226727/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:2218654/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:2176812/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:217434/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:2112364/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:732437/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:972011/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:970413/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:906349/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:886742/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:875519/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:801228/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:784444/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:755159/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:568682/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:718016/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:668912/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:650067/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:64742/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1974495/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:613631/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:583082/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:152888/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1085850/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:109004/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1150453/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1201421/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1220366/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1226599/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1248560/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1267683/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1273239/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1282240/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1402151/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1403328/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:143358/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1468595/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1486637/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1757742/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:2059249/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:2004627/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1047072/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:197335/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1944641/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1939867/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1896122/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1813216/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:211032/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1685994/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:165681/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1639805/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1624979/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1603856/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGc  >  1:1587617/1‑66 (MQ=255) cACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATACACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTgg   >  1:1384703/1‑65 (MQ=255) |                                                                  CACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGC  >  minE/1166527‑1166592

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑