Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1172037	1172041	5	11 [0]	[0] 16	ynjI	predicted inner membrane protein

ATACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAG  >  minE/1172042‑1172106 |                                                                 aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:1270646/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:1437625/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:1445750/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:1471171/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:1879240/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:2165825/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:2211371/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:2256238/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:36322/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:667497/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:69046/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:896894/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:903869/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:914146/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:938099/65‑1 (MQ=255) aTACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAg  <  1:956824/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATACCCCATTGATCCTCTAAAGACTCGCGTCTTTTACTTATGATATCGATCGAGTCAAAAGGAAG  >  minE/1172042‑1172106

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑