Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1176569	1176577	9	34 [0]	[0] 9	sppA	protease IV

TCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTG  >  minE/1176578‑1176644 |                                                                   tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:1033473/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:1404901/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:1425404/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:1843116/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:1890332/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:2002179/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:2301084/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:566771/67‑1 (MQ=255) tCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGtgtg  <  1:970504/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTATTTTCCTCGTACTGGTTGGTGTG  >  minE/1176578‑1176644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑