Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	15890	15955	66	4 [0]	[0] 34	mokC/nhaA	regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC/sodium‑proton antiporter

AATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGA  >  minE/15956‑16021 |                                                                  aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAg                              >  1:234549/1‑38 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGa        >  1:778343/1‑60 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGTAAgaga  >  1:1884259/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:721873/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:2314587/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:276443/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:384068/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:481652/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:645558/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:673297/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:2136423/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:740075/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:783257/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:794366/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:818769/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:866577/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:903156/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:915026/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1011623/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:2008848/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1998033/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:199752/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1922061/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1902281/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1856261/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1662830/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1638799/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:163470/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1375723/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1279961/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1248761/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1209189/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:120213/1‑66 (MQ=255) aaTCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAgaga  >  1:1067400/1‑66 (MQ=255) |                                                                  AATCTGATTTTAACGATGATTCGTGCGGGGTAAAATAGTAAAAACGATCTATTCACCTGAAAGAGA  >  minE/15956‑16021

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑