Missing coverage evidence...
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CAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTC  >  minE/1351971‑1352037 |                                                                   cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGTTGTc  <  1:295272/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:147166/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:921348/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:879614/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:873811/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:680039/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:627800/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:598173/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:594733/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:58794/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:546679/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:541510/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:530583/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:465827/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:342805/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:322213/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:269878/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2302849/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2229118/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2212862/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2134196/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2129374/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2121458/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2102549/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:2035135/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:1968873/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:178028/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:17092/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:1566518/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:1481413/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTc  <  1:104059/67‑1 (MQ=255) cAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGCTGTc  <  1:295122/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CAACTTCCAGCGTGTCGGCCTGGGCTAACGCCGATGAAAGCCAGCTTTTTGCCTCCTGTACGGTGTC  >  minE/1351971‑1352037

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑