Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1448857	1448862	6	2 [0]	[0] 16	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

TCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCT  >  minE/1448863‑1448928 |                                                                  tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAAt      >  1:2052982/1‑62 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGc   >  1:144762/1‑65 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:120153/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:1422544/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:1650286/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:1832307/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:1994515/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:2050282/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:226302/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:286559/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:526756/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:685067/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:738051/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:778737/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCt  >  1:899459/1‑66 (MQ=255) tCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTAAGCAATTGc   >  1:892290/1‑65 (MQ=255) |                                                                  TCAGGAATATCTGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCT  >  minE/1448863‑1448928

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑