Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1498145	1498164	20	7 [0]	[0] 23	nuoC	NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain C,D

CGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCC  >  minE/1498165‑1498230 |                                                                  cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAAGTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1062582/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGtt                  >  1:153959/1‑50 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1860194/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:994296/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:962123/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:959360/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:916666/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:759551/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:716956/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:2282925/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:2127452/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:2114516/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:2082506/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:2002660/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1802932/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1787559/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1540241/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1540071/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1488446/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1444473/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1391366/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1344133/1‑66 (MQ=255) cGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGcc  >  1:1068154/1‑66 (MQ=255) |                                                                  CGGGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCC  >  minE/1498165‑1498230

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑