Missing coverage evidence...
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TGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGTT  >  minE/1528511‑1528576 |                                                                  tgtgctATTACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:1824607/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTg                >  1:1933531/1‑52 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:2243703/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:840855/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:836703/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:783333/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:71179/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:677542/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:584196/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:474216/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:326363/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:237625/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:114415/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:2170722/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:214628/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:205245/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:201369/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:1607238/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:1441162/1‑66 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGt   >  1:647267/1‑65 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGt   >  1:1805633/1‑65 (MQ=255) tgtgctATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATAGTATTGGTGCCAGtt  >  1:1495731/1‑66 (MQ=255) tgtgctACGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:1547430/1‑66 (MQ=255) tgtgatATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGtt  >  1:296100/1‑66 (MQ=255) |                                                                  TGTGCTATGACGGTTATCTCACGCCACAAAATCCGGCGAATCAACATCATTGTATTGGTGCCAGTT  >  minE/1528511‑1528576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑