Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1557786	1557794	9	17 [1]	[0] 18	emrY	predicted multidrug efflux system

ATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAC  >  minE/1557795‑1557861 |                                                                   aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGGTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:2007476/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:216513/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:958468/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:853975/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:849421/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:648516/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:55544/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:480295/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:246679/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:2279570/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:1155553/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:2143805/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:2123245/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:1993539/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:1966190/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:1949706/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:189202/67‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAc  <  1:133305/67‑1 (MQ=255) |                                                                   ATTAAAGTTGTCCATTATGCGAAATAATGTTGCTAATTTCTTTTTCTATCGGACTGGTATCGATAAC  >  minE/1557795‑1557861

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑