Missing coverage evidence...
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CTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAG  >  minE/1672044‑1672093 |                                                  cTCACCAGAGCGCAAATCGTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:692796/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:331498/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:98699/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:874367/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:809670/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:786284/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:695934/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:544325/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:468103/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:455831/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:350597/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:345654/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:1028841/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:2175623/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:2173698/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:2118384/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:2109524/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:2060918/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:2042466/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:1988362/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:198237/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:1636154/1‑50 (MQ=255) cTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAg  >  1:1618569/1‑50 (MQ=255) |                                                  CTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAG  >  minE/1672044‑1672093

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑