Missing coverage evidence...
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GGACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGCGCG  >  minE/1727082‑1727147 |                                                                  ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:607386/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:24114/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:316095/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:335074/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:346168/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:434963/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:441422/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:544377/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:592133/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:2157122/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:629992/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:699167/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:751138/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:852803/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:890747/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:939325/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:969364/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:105743/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:2118382/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:2093486/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:2034331/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:2018735/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1987813/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:191210/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1825705/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1778858/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1608770/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:156475/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1534007/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1303731/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1187470/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1138837/66‑1 (MQ=255) ggACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGcgcg  <  1:1106309/66‑1 (MQ=255) |                                                                  GGACGACCAAATTCGTTGTTAAACGCCGCGCCGCCCAGCGGGCCTTCGGTCATGATGTCCAGCGCG  >  minE/1727082‑1727147

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑