Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1742191	1742211	21	2 [0]	[0] 27	rpoE	RNA polymerase, sigma 24 (sigma E) factor

TGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAT  >  minE/1742212‑1742277 |                                                                  tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCCGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1322163/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1962656/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:98360/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:898086/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:778843/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:721065/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:631750/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:607079/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:526957/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:508944/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:296989/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:2313088/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:2146596/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:2051519/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1994375/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1048506/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1663334/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:16333/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1540404/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1498551/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1442513/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1436428/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1308540/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1307866/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1226850/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:1175441/66‑1 (MQ=255) tGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAt  <  1:106421/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TGATAGCGGCTATCTCTTCATAGCTCAGGCCATCCAGCTCCCGCAAGGTTATTGCCATGCGTAAAT  >  minE/1742212‑1742277

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑