Missing coverage evidence...
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TTATCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTATTGTTG  >  minE/1756263‑1756307 |                                             ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGTGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1423441/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:378438/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:2133540/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:2182776/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:2222598/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:234031/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:288935/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:311822/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:343599/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:2049267/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:438666/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:668247/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:705871/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:713376/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:733923/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:928069/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:951190/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1057008/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1990480/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1788287/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1595329/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:157065/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1482942/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1416605/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1403315/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1395932/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1378149/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1287222/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:128174/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1233967/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1090269/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:1080683/45‑1 (MQ=255) ttatCCAGTTGCTGCGCGAACGGAAAAAGGTCGAAATTAttgttg  <  1:291567/45‑1 (MQ=255) |                                             TTATCCAGTTGCTGCGCGAAGGGAAAAAGGTCGAAATTATTGTTG  >  minE/1756263‑1756307

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑