Missing coverage evidence...
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ATCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACAGA  >  minE/1811921‑1811985 |                                                                 aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:634775/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1012145/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:245471/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:2895/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:429361/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:520003/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:532291/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:534732/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:548457/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:551650/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:2316559/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:710158/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:71834/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:743030/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:830666/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:855328/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:864478/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:958696/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:959331/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:962147/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1744531/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1095649/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1209406/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1215316/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:130860/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1448342/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1468549/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:147085/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1628294/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1673943/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1722332/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:2224966/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1818306/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1823132/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1905225/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:1981966/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:2054741/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:2155068/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:2196281/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:2221618/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGGCAAAAAGAGTGTTTTATCAACaga  <  1:256595/65‑1 (MQ=255) aTCGTTTGCAAACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACagt  <  1:244318/65‑2 (MQ=255) |                                                                 ATCGTTTGCACACTTCACGTTCAATTAGTCTGTAAAAACGTCAAAAAGAGTGTTTTATCAACAGA  >  minE/1811921‑1811985

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑