Missing coverage evidence...
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ATGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACG  >  minE/1835216‑1835282 |                                                                   aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGTCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:554250/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCTCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1171702/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:2142720/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:986006/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:921593/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:918840/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:886620/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:815895/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:532390/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:476208/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:43566/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:38858/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:339264/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:231449/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:2236534/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:2172942/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1013642/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:2078567/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1912472/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1904/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1890510/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1884148/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1827076/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1763707/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1718514/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1718474/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1575135/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:145859/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1078067/67‑1 (MQ=255) aTGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACg  <  1:1076476/67‑1 (MQ=255) |                                                                   ATGCTCACTGTTCACGTGGCGGTACCGCCGCATCCAGGCCCTGTCGCCGCAGCGGGGTTACTCCACG  >  minE/1835216‑1835282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑