Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1836472	1836543	72	42 [0]	[0] 17	rpoS	RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor

GGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATC  >  minE/1836544‑1836610 |                                                                   gggTGTCTACCGAGGTAATGCTTTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:463347/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:2009353/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:773244/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:735864/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:39983/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:366995/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:347085/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:2102676/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:2059460/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:1072069/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:1775034/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:1647040/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:1568858/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:1245190/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:121759/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:1123499/67‑1 (MQ=255) gggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATc  <  1:1117668/67‑1 (MQ=255) |                                                                   GGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATC  >  minE/1836544‑1836610

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑