Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1840418	1840426	9	22 [0]	[0] 42	truD	pseudoruidine synthase

GGTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGA  >  minE/1840427‑1840491 |                                                                 ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGc                                >  1:2008364/1‑35 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:44903/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:2168788/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:224920/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:2253695/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:2314215/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:244609/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:352027/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:352628/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:376382/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:415356/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:2144840/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:450089/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:616817/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:640853/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:640863/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:787136/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:87995/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:887962/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:977556/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:993440/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:197239/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1163704/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1250483/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1272730/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1314419/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1325361/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1428133/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1431594/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1513751/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1616409/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1670041/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:167138/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1762311/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1822673/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1845220/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1845634/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1878046/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:189121/1‑65 (MQ=255) ggTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGa  >  1:1117240/1‑65 (MQ=255) ggTTAGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCaaaa               >  1:298912/1‑52 (MQ=255) ggTTAGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCAcc    >  1:1141592/1‑63 (MQ=255) |                                                                 GGTTTGCGCCCAGCGCTGCGCCCCCTGCAAGTTGCTACCGCCAATCCCAAAACGTTGGGCACCGA  >  minE/1840427‑1840491

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑