Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	93544	93579	36	25 [0]	[0] 43	secA	preprotein translocase subunit, ATPase that targets protein precursors to the SecYE core translocon

CGCGACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGACG  >  minE/93580‑93646 |                                                                   cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTaa                         >  1:1771227/1‑44 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAAc                       >  1:2151843/1‑46 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCtggtgg     >  1:791185/1‑64 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCtggtgg     >  1:1389860/1‑64 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:345511/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2019576/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2039586/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2044517/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2046773/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2146368/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2152333/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2290981/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:2311893/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1954442/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:355840/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:525600/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:610690/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:651591/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:82073/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:831327/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:840667/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:997052/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:144240/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1041882/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1197926/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:12073/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1334778/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1356720/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1366379/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1402153/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1991524/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1481375/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1517011/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:169827/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1732866/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1819743/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1828443/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1903039/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1928326/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1019042/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGACg  >  1:1104519/1‑67 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTCTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:1358898/1‑65 (MQ=255) cgcgACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGAGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGa    >  1:65702/1‑65 (MQ=255) |                                                                   CGCGACAACATGGCGTTCAGCCCTGAAGAACGTGTACAGCGTAAACTGCACTATGCGCTGGTGGACG  >  minE/93580‑93646

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑