Missing coverage evidence...
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ATAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATAATGAAT  >  minE/2082910‑2082976 |                                                                   aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:60536/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:2180557/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:27529/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:286635/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:33561/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:37117/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:410381/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:504178/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:580705/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:601641/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:21410/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:640082/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:653653/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:679601/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:684714/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:687383/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:689598/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:798929/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:962190/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1786388/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1039121/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1079879/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1200579/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:130974/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1387371/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1421167/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1451823/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1485027/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1758479/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1030884/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1801426/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1863184/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:1875307/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:2053640/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:2060799/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:2113766/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:2116285/67‑1 (MQ=255) aTAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATaatgaat  <  1:2118850/67‑1 (MQ=255) |                                                                   ATAACATTGCGGTAGTGCATCTTTTAAAACCAGCGTGGCGTTAACCGATTCACCAGGAATAATGAAT  >  minE/2082910‑2082976

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑