Missing coverage evidence...
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TTGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGA  >  minE/2144784‑2144849 |                                                                  ttGCCAGCCAGATCACTGGTTAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:2203664/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1999570/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:866542/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:712946/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:648082/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:630987/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:604956/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:542485/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:53804/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:2187748/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:2118453/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:2116088/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:2086198/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:2015531/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1016401/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1996960/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1933027/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1852957/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1697050/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1576305/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1546038/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1375301/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:129522/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:127783/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1090400/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1083876/66‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGa  <  1:1033300/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TTGCCAGCCAGATCACTGGTGAAGTTACCCTGGAGCTGCGCCGTGGGAACGATTATTCAATCCTGA  >  minE/2144784‑2144849

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑